Instituttet, der kan se tilbage på en rig medmenneskelig historie, blev grundlagt i 1979 af overlæge Mogens A. Lund, soc.rdg. Lis Keiser og familieterapeut Jesper Juul i samarbejde med den amerikanske psykiater og familieterapeut Walter Kempler, M.D.
Formålet var at udvikle en egentlig psykoterapeutisk videreuddannelse med familieterapi som speciale.

Kempler Instituttet er gennem årene blevet ledet af Jesper Juul frem til 2003, af Annelise Dalsgaard frem til 2007 og af Susanne Broeng frem til 2010. Fra 2010 til ultimo 2011 er Instituttet blevet ledet af Susanne Broeng og Lasse McCraie. Fra 2012 er instituttet ledet af Lasse McCraie.

Instituttet har vokset sig stort og vidtforgrenet på et solidt fundament af oplevelsesorienteret familieterapi, der har rod i den humanistisk-eksistentialistiske teoridannelse.

Historisk har de vigtigste eksponenter for den oplevelsesorienterede terapiform været Carl Rogers´ såkaldt klientcentrerede terapi og Fritz Perls´ gestaltterapi, der begge tog afsæt i 1950´ernes USA.

Teoretiske rødder